O cálculo de cubagem é para utilizar o valor de peso a partir das dimensões do pacote, para poder ter o retorno do valor de frete correto.
Você pode configura-lo nas configurações de transportadora:
1. Vá para o menu Cadastro > Frete (Novo) > Transportadora;
2. Selecione a transportadora e clique em
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Neste exemplo, escolhemos a transportadora Correios.
3. Escolha o tipo de serviço clicando em 
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Abrirá o menu de configuração do tipo de serviço, nele configuramos o cálculo de cubagem a partir do campos Fator Cubagem e Considerar peso cúbico se este passar de.
4. Preencha os campos:
- Fator Cubagem: Insira o número que define, qual seria a cubagem ideal. Normalmente, é fornecido pela transportadora.
- Considerar peso cúbico se este passar de: Insira a partir de qual peso será considerado o peso cúbico. Caso o peso cúbico for maior que o valor configurado, será considerado o maior peso entre o peso do produto e peso cúbico para retorno de frete.
5. Clique em Confirmar.
Ou seja, ao produto ser cotado será realizado o cálculo de peso cúbico (Largura x Altura x Comprimento x Quantidade x Fator Cubagem), se este peso passar do valor configurado no campo "Considerar peso cúbico se este passar de", será considerado o peso do cálculo.